肠道菌群

Intestinal flora

16S、18S、ITS高通量测序

一、简介

      16S/18S/ITS rDNA可以做作为揭示生物物种的特征核酸序列, 被认为是适于微生物系统发育和分类鉴定的指标。如今,16S/18S/ITS rDNA扩增子测序技术已成为研究环境样本中微生物群落组成结构的重要手段。

      16S rDNA扩增子测序,是通过特异性引物扩增样本中原核生物16S rDNA的可变区,构建高通量测序文库并对16S rDNA可变区序列进行分析,从而鉴定环境中原核微生物的组成与丰度的方法。

      18S/ITS rDNA扩增子测序,是通过特异性引物扩增样本中真核生物18S/ITS rDNA的可变区,构建高通量测序文库并对18S/ITS rDNA可变区序列进行分析,从而鉴定环境中真核微生物的组成与丰度的方法。


二、分析流程

      16S/18S/ITS rDNA扩增子测序的实验流程包括样本基因组DNA的提取与质检,16S/18S/ITS rDNA可变区扩增与测序文库构建,高通量测序等多个步骤。为了保证源头数据的准确性与可靠性,我们对每一步实验过程都进行严格质控,检测合格后,按照目标数据量调整文库体积,将多个文库混合后进行Illumina MiSeq测序。具体实验流程如下:



      数据下机后,生物信息分析流程如下:


三、结果展示

1. 物种分布


2. 多样性分析


3. 组间群落结果差异显著性分析

      

4. PICRUSt功能预测分析


四、服务优势

结果更真实: 多套引物设计,同时检测细菌和古细菌,真实反映菌群组成。

检测区域更多: 同时检测V3、V4和V5 三个可变区,显著提高检测能力。

读长更长: MiSeq(PE300)测序,大幅提高测序读长和检测的准确性。

数据量更大: 不低于5万 reads/样品, 保证检测到样品中的痕量微生物。

方案灵活多变: 多套引物和实验方案,全面解决细菌、古菌、真菌的各类检测需求,能检测真核生物DNA含量较高的样品。

周期更短: 采用MiSeq测序,方便快捷,最短20个工作日交付检测报告。

价格更实惠: 流程化实验操作,节省您的每一分科研经费。