16S rRNA测序
16S扩增子测序即通过提取微生物样品的DNA,选择合适的通用引物扩增16S的某一或某几个区,使用Illumina MiSeq将目的区域正反向读通,通过检测目的区域的序列变异和丰度,对环境样本物种分类及丰度、种群结构、系统进化、群落比较等方面信息进行分析的研究方法,是微生物研究中最重要的手段之一。
代谢组学是对一个生物体系在特定时间和条件下所有小分子代谢物质的定性定量分析,从而描述生物内源性代谢物的整体及其对内、外因素变化应答规律一门新兴科学,已广泛应用于疾病早期诊断、病因病机研究、药物毒理学、中医药现代化、植物代谢组学、微生物代谢组学、营养学、环境科学等领域。
短链脂肪酸(SCFA)主要由膳食纤维、抗性淀粉、低聚糖等不易消化的糖类在结肠受乳酸菌、双歧杆菌等有益菌群酵解而产生,主要包括乙酸、丙酸、异丁酸、丁酸、异戊酸、戊酸等。SCFA不仅具有氧化供能的作用,而且还有维持水电解质平衡、抗病原微生物及抗炎、调节肠道菌群平衡、改善肠道功能、调节免疫、抗肿瘤和调控基因表达等重要作用。
胆汁酸是一大类胆烷酸的总称,在脂肪代谢中起着重要作用。胆汁酸的生理功能可概括为:影响胆汁分泌、促进肠道对脂类物质的吸收并影响肠道功能。胆汁酸的检测可用于探索胆汁酸在各种疾病中的病因学、发病机理中所发挥的作用,挖掘其在疾病诊断、治疗及预后过程中的重要价值。
TMAO及相关代谢物水平与心血管疾病、心肌梗死、卒中、糖尿病、慢性肾病、癌症等多种疾病密切相关。TMAO及相关代谢物的完全定量分析可为相关疾病的诊断及预测、病因病机研究、疗效评估等方面提供可靠的依据。
肠道菌群-宿主代谢物检测
肠道细菌能够参与宿主代谢,与宿主构成共代谢关系。肠道菌群代谢物的准确测定,作为一种相对全面、连续动态并无刺激的分析手段,它可客观地检测肠道微生物的代谢组分及浓度变化,展示肠道菌及宿主的代谢状态,在肠道菌群和宿主代谢互作的疾病机制及防控研究中意义重大,是该研究领域创新的基础工具方法。